刘新华：党组书记、局长，主持全面工作。负责党建、党风廉政建设、统筹水利重大事项。分管机关党委、水政监察支队。
刘平：党组成员、副局长，负责组织人事、机关作风建设、目标考核、劳资、安全生产、社会治安综合治理、政务公开、职称评定、信访、保密、档案、机关管理和基本建设、规划、计划、统计、招投标管理、重大项目、陆海统筹等工作。分管办公室（组织人事处）、规划与建设处、南通市九圩港闸管理所。联系海安县水利工作。
赵建华：党组成员、副局长，负责农村水利、农村环境（市郊）长效管理、水土保持、水利科技、水利绿化、机电排灌和财务审计等工作。分管农村水利处（科技处）、长效办、财务审计处、市区涵闸管理中心。联系如皋市水利工作。
江宏：党组成员、纪检组长，负责纪检监察工作，分管监察室，联系通州区水利工作。
陆建平：副局长，负责工程管理、市区水环境治理、沿海开发水利等工作。兼管防汛防旱工作。分管水利工程管理站（城市河道建设管理中心）、市区水环境综合整治办公室，联系滨海园区水利工作。
曹建华：党组成员、局长助理，负责水利政策法规、依法行政、法制建设、水资源管理、节约用水、水生态文明建设、水文等工作。分管水资源处（政策法规处）、（行政服务处）、市节约用水办公室（市区水资源管理处）。联系市水文局、如东县水利工作。
周兴余：党组成员、局长助理，负责防汛防旱、引江调水、城市防洪、突发公共事件应急管理、市区河道管护、水环境稽查、城市创建、数字城管等工作。分管防汛防旱处（防办）、南通市节制闸管理所，协助分管城市河道建设管理中心。联系崇川区水利工作。
曹华：党组成员、局长助理，负责水利工程质量监督、安全管理、行政审批等工作，分管水利工程质量安全监督站、行政审批窗口。联系港闸区、开发区（苏通园区）水利工作。
喻福涛：副调研员，负责九圩港泵站工程建设。
陈宏：享受原职级待遇。协助局领导工作，负责水利学会工作。
丁贤俊：副调研员，负责水政监察工作。协助分管水政监察支队，联系海门市水利工作。
沈波：机关党委书记，主持机关党委全面工作，负责党务、党风廉政建设主体责任日常工作、精神文明建设、结对帮扶、水利志编撰和供排水管理等工作，分管供排水管理处、工会、青年团、妇女工作。
卢建均：副调研员，负责水利调研、新闻宣传、信息化建设、网络安全、干部学习教育、老干部和农村环境（市效）长效管理工作。协助分管办公室、长效办。联系启东市水利工作。