刘新华：党组书记、局长，主持全面工作。分管水政监察支队。
刘 平：党组副书记、副局长，负责党建、组织人事、机关作风建设、目标考核、劳资、安全生产、社会治安综合治理、政务公开、职称评定、信访、保密、档案、机关管理和基本建设、规划、计划、统计、招投标管理、重大项目、水利工程质量安全监督管理、九圩港提水泵站工程建设、陆海统筹等工作。分管机关党委、办公室（组织人事处）、规划与建设处（质量与安全监督处），南通市九圩港水利工程管理所、九圩港提水泵站建设工程处。
赵建华：党组成员、副局长，负责农村水利、农村环境（市郊）长效管理、水土保持、水利科技、水利绿化、机电排灌和财务审计等工作。分管农村水利处（科技处）、长效办、财务审计处。联系如皋市水利工作。
陆建平：副局长，负责工程管理、市区水环境治理、沿海开发水利、花园城市建设等工作。分管水利工程管理站（城市河道建设管理中心）、市区水环境综合整治办公室、市区涵闸管理中心。联系滨海园区水利工作。
曹建华：党组成员、局长助理，负责水利政策法规、依法行政、法制建设、水资源管理、节约用水、水生态文明建设、水文等工作。分管水资源处（政策法规处）、（行政服务处）、市节约用水办公室（市区水资源管理处）。联系如东县水利工作。
周兴余：党组成员、局长助理，负责防汛防旱、引江调水、城市防洪、突发公共事件应急管理等工作。分管防办、防汛防旱处、南通市节制闸管理所。联系崇川区水利工作。
曹 华：党组成员、局长助理，负责行政审批工作，分管行政审批窗口、新江海河闸管理所（通海闸管所）。联系开发区（苏通园区）水利工作。
冯 斌：党组成员、纪检组长，负责纪检监察工作，分管监察室，联系通州区水利工作。
喻福涛：副调研员，负责九圩港泵站工程建设。
陈 宏：享受原职级待遇。协助局领导工作，负责水利学会工作。
丁贤俊：副调研员，负责水政监察工作。协助分管水政监察支队，联系海门市水利工作。
沈 波：机关党委书记，主持机关党委全面工作，负责党务、党风廉政建设主体责任日常工作、精神文明建设、结对帮扶、水利志编撰和供排水管理等工作，分管供排水管理处、工会、青年团、妇女工作。联系海安县水利局工作。
卢建均：副调研员，负责水利调研、新闻宣传、信息化建设、水文化建设、网络安全、干部学习教育、老干部和农村环境（市效）长效管理工作。协助分管办公室、长效办。联系启东市水利工作。
施 健：副调研员，负责市区河道管护、水环境稽查、城市创建、政府12345热线、数字城管等工作，协助分管城市河道建设管理中心、市区涵闸管理中心。联系港闸区水利工作。